Здесь я нашел проблема, что у нас через выпуск NetBeans 7.0.1, хотя я уверен, что причина не относится к IDE, но проживают в другом месте. На практике, после обновления NetBeans вел себя, как если бы он был полностью в автономном режиме, возвращается сообщение об ошибке соединения тайм-аут не только при публикации проекта, но и начали скачивать обновления с официальных репозиториев.

Для решения этой проблемы просто Google, но решение только я здесь, потому что я хочу, чтобы не потерять то же время в будущем, если когда-нибудь вы столкнулись подобный случай. Мне кажется, причина тайм-аута является тот факт, что один из классов Java, посвященный управлению IPv6 сети приманки, если оно не указано иначе, добавив следующий флаг в файл netbeans.conf:

-J-Djava.net.preferIPv4Stack=true

Флаг добавляется к другим, которые в строке 6 из файла конфигурации:

netbeans_default_options="-J-client -J-Xss2m -J-Xms32m -J-XX:PermSize=32m -J-Dapple.laf.useScreenMenuBar=true -J-Dapple.awt.graphics.UseQuartz=true -J-Dsun.java2d.noddraw=true -J-Djava.net.preferIPv4Stack=true"

Я надеюсь, что эта информация может быть полезной для других.